Katoliku vandenõud ja Hispaania armada
Need salajased jõupingutused viiksid otseselt kahe tõsisema krundi paljastamiseni Elizabethi omastamiseks ja katoliikluse taastamiseks Inglismaale. Prantsuse saatkonnas Londonis asuv spioon, kes on tõenäoliselt tuvastatud kui Giordano Bruno (kirjutatakse pseudonüümi all Henry Fagot), aegunud dominiiklaste vend, kes võiks hiljem saada tuntust itaalia renessansiajastu vabalt mõtleva filosoofina, hoiatas Walsinghami salajases kirjavahetuses. Mary, mida juhiti läbi saatkonna. Krunt purustati peaministri vahepealiku Francis Throckmortoni arreteerimisega novembris 1583. Tema valduses olid süüdistavad dokumendid, sealhulgas sissetungisadamate kaart ja Inglismaal asuvate katoliku toetajate nimekiri. Throckmorton paljastas piinamise ajal Hispaania ja Prantsuse vägede poolt Inglismaale sissetungi plaani koos Maarja järgijate tõusuga. Hispaania suursaadik saadeti riigist välja ja diplomaatilised kontaktid Hispaaniaga katkesid.
Teine vandenõu, Babingtoni maatükk (nimetati vandenõu Anthony Babingtoni jaoks), paljastus augustis 1586 Walsinghami topeltagentide ja koodiekspertide abiga, kes, Maarja esindajate teadmata, varustasid Maarjaga kodeeritud kirjade kaudu suhelda. smugeldati õllevaadri sees. Kirjad kinnitasid Maarja kaasosalust Elizabethi ärapetmises, mis viis Maarja kohtuprotsessini, süüdimõistmiseni ja hukkamiseni.
Walsinghami luuretöö osutub oluliseks ka eelseisvas sõjas Hispaaniaga. Ta aitas varjata Sir Francis Drake'i üllatusreidi ettevalmistamist Cádizi sadamas aprillis 1587, edastades tahtlikult vale teate Drake'i plaanide kohta Inglise suursaadikule Pariisis, kelle Walsingham oli õigesti arvanud, et see on Hispaania palgal. Walsinghami arvukad spioonid edastasid üksikasjalikke teateid Hispaania ettevalmistustest Armada purjetamiseks Inglismaa vastu juulis 1588.
Walsingham oli abielus kaks korda (mõlemad korduvalt lesega naised): Anne Barnes Carleilliga (mõnikord kirjutatud Carlyle) 1562 ja pärast surma Ursula St. Barbe Worseleyga 1566. Tema tütar Frances (1567–1632) abiellus kaks järjestikku. Elizabethi siseringi silmapaistvamatest tegelastest: luuletaja ja kohusetäitja Sir Philip Sidney (1583) ning Essexi 2. kirikupead Robert Devereux (1590), Elizabethi lemmik, kes hukati riigireetmise tõttu 1601. aastal pärast ebaõige riigipöördekatset. (Tema kolmas abikaasa oli Clanricarde'i 4. krahv Richard Burke.) Walsingham sai kroonilt mitmeid tulusaid eelistusi ja mõisaid, sealhulgas Richmondi palee lähedal asuvat Barn Elmsi mõisa. Kuid ta suri ilmselt märkimisväärsetes võlgades, osaliselt seetõttu, et oli võtnud Sidney pärandvara võlad.
