Erinevates kunstilistes esindustes on Angkor Wat keskne hoone khmeeri riigilippude kohal ilmunud alates 19. sajandist, Prantsuse protektoraadi algusaegadel Kambodža kohal. Esimene lipp oli punasega siniselt ääristatud ja tempel valge. Lipp “moderniseeriti” 1948. aastal tumesinise, punase ja tumesinise ebavõrdse horisontaalse triibuga ning templit muudeti nii, et see vastaks paremini originaalile. Seda lippu kasutati ka pärast Kambodža iseseisvumist. Monarhia lõppemise ja Khmeri Vabariigi väljakuulutamise tulemuseks oli aga uus lipp oktoobris 1970. “Tuumilipuks” sai kanton, põllul aga sinised kolm valget tähte.
Esmalt kasutasid kommunistlikud mässulised lippu aastatel 1948–70, kuid võimule tulid 1975. aasta aprillis tavalise punase lipu all. Kui nende demokraatlik Kampuchea võttis 1976. aasta jaanuaris vastu põhiseaduse, asetati kolmest tornist kollase templi siluett punase lipu keskele, asendades selle vaid viiekorruselise kollase templiga, kui Vietnami toetatud väed kuulutasid Kampuchea rahvavabariigi välja. 1979. aastal võtsid konkureerivate Kambodža osariigi (Khmer Rouge) ja Kambodža (Vietnami) valitsused enne Ühinenud Rahvaste Organisatsiooni administratsiooni kasutusele lipu edasise kohandamise, mis heiskas helesinise lipu, mille keskel asuv riigi siluettkaart hõlmas. ÜRO aitas lõpetada tsiviilkonfliktid ja see viis riigi vabade valimisteni 1993. aastaks. Sama aasta 30. juunil heisati taas 1948–70 lipp.
