Esimesel, 1893. aastal vastu võetud lipul, proua Edward H. Keskuse kujundatud lipul, esiküljel oli valge pitser, riigi nimi ja 19 kuldset tähte, mis sümboliseerisid Minnesotat 19. osariigina, et järgida originaali 13; lipu tagakülg oli tavaline sinine. Seda lippu kasutati vähe, osaliselt seetõttu, et selle kujundust ei olnud lihtne kvantitatiivselt toota. 19. märtsil 1957 loodi uus kujundus; lipu taust, nagu paljude teiste riigilippude taust, pidi edaspidi olema mõlemalt poolt sinine. 1893. aasta algse lipu keskne kujundus ilmus ümmarguse kujul uue lipu mõlemal küljel.
1. augustil 1983 tehti riigipitseris muudatused. Varem oli näidatud, et hüljes olnud Ameerika indiaanlane põgenes maapiirkonnast, kus talunik kündis, samal ajal kui tema muskett ja pulbri sarv puhkasid. Muudetud kujundus sisaldab endiselt paigaldatud indiaanlasi ja muid sümboleid, kuid sellega välditakse algset soovitust, mille kohaselt tsivilisatsiooni edasiminek eeldab maa algsete elanike lahkumist. Pitserisse jäävad ka Püha Anthony juga, loojuva päikese ja daamide sussilillede piirid koos esimese Euroopa asunduse kuupäevadega Minnesotas (1819), riiki lubamise (1858) ja vastuvõtmisega esimese riigilipu all. Riigi moto “L'Étoile du nord” (“Põhja täht”) on näidatud punasel lindil. (Enne Alaska liitu astumist oli Minnesota põhjapoolseim osariik.)
