Kromofoor - aatomite ja elektronide rühm, mis moodustab osa orgaanilisest molekulist, mis põhjustab selle värvuse.
Keemiliste ühendite struktuuriliste omaduste ja nende värvide vahel on otsitud seoseid alates umbes 1870. aastast, mil märgiti, et kinoonid ning aromaatsed aso- ja nitroühendid on sageli erivärvilised ning ühendite hüdrogeenimisel värvid vähenevad või hävivad. Ühendi vesiniku omastamise võime, mida nimetatakse küllastumatuks, on tingitud elektronide olemasolust, mis ei ole kindlalt aatomipaaride vahel kovalentsetes sidemetes fikseerunud, kuid hõivavad suuremaid kosmosepiirkondi (molekulaarsed orbitaalid), mis võivad olla seotud mitme aatomiga. Need elektronid suudavad valguse energiat neelata nähtava piirkonna teatud lainepikkuste vahemikus; Ülejäänud valguse läbilaskvus või peegeldus annab ühendi täheldatud värvuse. Sügav värvus on tulemus, kui samas molekulis on tihedalt ühendatud mitu kromofoori või kui on olemas mõni teine rühm, mida nimetatakse auksokroomiks.
