Kootenay jõgi, ka speltanisuga Kootenai, oja Põhja-Ameerika lääneosas, mis tõuseb Kaljumäestiku läänes Banffist Alta. Can. See voolab lõuna suunas läbi Kootenay rahvuspargi Briti Columbias, Canadias, puhkedes Kaljumäest välja, et voolata Kalju mäe kraavis üldiselt lõunasse. See liigub lõunas USA-s Montanasse laia U-kujulise ahelaga, seejärel põhja poole Idaho ja tagasi Kanadasse, enne kui see laieneb pikaks, kitsaks Kootenay järveks Briti Columbias; järve lääneosast suubub see Columbia jõkke Castlegari juures.
Ligikaudu 130 miili (210 km) 485 miili (780 km) pikkusest jõest asub Ameerika Ühendriikides. Kootenay langeb Kootenay järve ja Columbia jõe vahel 40 miili (40 km) kaugusel 365 jalga (111 m). Selles lõigus varustavad mitmed tammid toitu basiiliku metalli sulatuselemendile ja rafineerimistehasele Trailis, BC. Jõgi on laevatatav Bonners Ferry'st, Idaho, Nelsonini, BC.
Kootenay, mille 1807. aastal uuris Briti karusnahakaupmees David Thompson ja mida kunagi nimetati Flat Bowiks, tuleneb selle nimest India sõnast, mis tähendab “veeinimesed”.
