Geelkromatograafia, mida nimetatakse ka geeli filtreerimiseksanalüütilise keemia meetod keemiliste ainete eraldamiseks, kasutades ära erinevusi kiiruses, millega need läbivad poorse pooltahke aine kihi. Meetod on eriti kasulik ensüümide, valkude, peptiidide ja aminohapete eraldamiseks üksteisest ja madala molekulmassiga ainetest. Segu komponentide eraldamine geelkromatograafia abil põhineb komponentide molekulide suuruse erinevustel. Väikesed molekulid kipuvad difundeeruma poorsete osakeste sisemusse, nii et nende vool on piiratud, samal ajal kui suured molekulid ei pääse pooridesse ja kipuvad takistamatult voolama. Seega lahkuvad kõigepealt kihist kõige suurema molekulmassiga komponendid, millele järgnevad järjest väiksemad molekulid. Kõige laialdasemalt kasutatavad voodimaterjalid on polüakrüülamiid ning dekstraanist ja epiklorohüdriinist valmistatud polümeer. Kuivad polümeerid suspendeeritakse tavaliselt sobivates ainetes homogeense, pooltahke segu saamiseks.
