Kapslid ja limakihid
Paljud bakterirakud eritavad mõnda rakuvälist materjali kapsli või limakihi kujul. Limakiht on bakteriga tihedalt seotud ja seda saab kergesti maha pesta, samal ajal kui kapsel on tihedalt bakteri külge kinnitatud ja sellel on kindlad piirid. Kapsleid saab valguse mikroskoobi all näha, pannes rakud India tindisuspensiooni. Kapslid välistavad tindi ja paistavad bakterirakke ümbritsevate selgete halodena. Kapslid on tavaliselt lihtsate suhkrute (polüsahhariidide) polümeerid, kuigi Bacillus anthracise kapsel on valmistatud polüglutamiinhappest. Enamik kapsleid on hüdrofiilsed (“vett armastavad”) ja need võivad aidata bakteril veetõbe ära hoida kuivamisest (dehüdratsioonist). Kapslid võivad kaitsta bakterirakku allaneelamise ja valgete vereliblede hävitamise (fagotsütoos) eest. Kuigi fagotsütoosist pääsemise täpne mehhanism on ebaselge, võib see ilmneda seetõttu, et kapslid muudavad bakterite pinna komponendid libedamaks, aidates bakteril pääseda fagotsütoossete rakkude omastamisest. Kapsli olemasolu Streptococcus pneumoniae-s on selle kopsupõletiku tekkevõime kõige olulisem tegur. S. pneumoniae mutantsed tüved, mis on kaotanud võime kapsli moodustada, on hõlpsasti levinud valgete vereliblede poolt ega põhjusta haigusi. Virulentsuse ja kapslite moodustumise seost leidub ka paljudes teistes bakteriliikides.
Rakuvälise polüsahhariidi kapselkiht võib ümbritseda paljud bakterid biokile ja täidab paljusid funktsioone. Streptococcus mutans, mis põhjustab hambakaariese, lõhestab sahharoosi toidus ja kasutab oma suhkru kapsli ehitamiseks ühte suhkrut, mis kleepub tihedalt hamba külge. Kapslisse kinni jäänud bakterid kasutavad ainevahetuse edendamiseks teist suhkrut ja tekitavad tugevat hapet (piimhapet), mis ründab hambaemaili. Kui Pseudomonas aeruginosa koloniseerib tsüstilise fibroosiga inimeste kopse, tekitab see algiinhappe paksu kapsli polümeeri, mis aitab bakterit hävitada. Perekonna Zoogloea bakterid eritavad tselluloosi kiude, mis ümbritsevad baktereid vedelikupinnal hõljuvaks floksiks ja hoiavad baktereid õhu käes - see on selle perekonna metabolismi nõue. Mõned vardakujulised bakterid, näiteks Sphaerotilus, eritavad pikki keemiliselt keerukaid torukujulisi kesta, mis ümbritseb olulist arvu baktereid. Nende ja paljude teiste keskkonnabakterite kestad võivad olla kaetud raua- või mangaanoksiididega.
Flagella, fimbriae ja pili
Paljud bakterid on liikumisvõimelised, suudades ujuda läbi vedela keskkonna või libiseda või sülem üle tahke pinna. Ujumis- ja sülembakteritel on flagella, mis on liikuvuseks vajalikud rakuvälised lisad. Flagellad on pikad spiraalsed kiud, mis on valmistatud ühte tüüpi valgust ja asuvad vardakujuliste rakkude otstes, nagu näiteks Vibrio cholerae või Pseudomonas aeruginosa, või kogu rakupinnal, nagu Escherichia coli. Flagellat võib leida nii grampositiivsetel kui ka gramnegatiivsetel vardadel, kuid kokki puhul on see harva esinev ja on lõksus spiroketi teljelises hõõgniidis. Flagellum kinnitatakse selle aluses rakumembraani põhikorpuse külge. Membraanil tekkivat protomootorjõudu kasutatakse flagellaarse hõõgniidi pööramiseks turbiinil, mida juhib vesinikuioonide vool läbi põhikorpuse rakku. Kui helbed pöörlevad vastupäeva, ujub bakterirakk sirgjooneliselt; päripäeva pöörlemise tulemuseks on ujumine vastassuunas või juhusliku kallutamise korral, kui raku kohta on rohkem kui üks flagellum. Kemoteksis võimaldab bakteril kohandada oma ujumiskäitumist nii, et see saaks tajuda ja liikuda atraktiivse kemikaali sisalduse suurenemise suunas või eemale tõrjuvast kemikaalist.
Bakterid ei suuda mitte ainult ujuda ega libiseda soodsama keskkonna poole, vaid neil on ka lisandid, mis võimaldavad neil pindadele kinni jääda ja voolav vedelik ei pese neid. Mõned bakterid, näiteks E. coli ja Neisseria gonorrhoeae, tekitavad sirged, jäigad spikulaarsed väljaulatuvad osad, mida nimetatakse fimbriae (ladina keeles niitide või kiudude jaoks) või pili (ladina keeles karvade jaoks), mis ulatuvad bakteri pinnalt ja kinnituvad teiste rakkude spetsiifiliste suhkrute külge - vastavalt nende tüvede, soole- või kuseteede epiteelirakkude jaoks. Fimbriad esinevad ainult gramnegatiivsetes bakterites. Teatavaid pilisid (nn soopilid) kasutatakse selleks, et üks bakter saaks seksuaalses paaritumisprotsessis, mida nimetatakse konjugatsiooniks, teise ära tunda ja selle külge kleepuda (vt allpool bakteri taastootmine). Paljud veebakterid tekitavad happelist mukopolüsahhariidi vastupidavust, mis võimaldab neil tihedalt kleepuda kivimite või muude pindade külge.
